تأسست جامعة الأحقاف بحضرموت – الجمهورية اليمنية بموجب القرار الوزاري رقم (5) لعام 1994م والصادر بتاريخ 27 شعبان 1414هـ الموافق 8 فبراير 1994م . وتمارس الجامعة من خلاله أعمالها الأكاديمية الفنية والإدارية والمالية وفقاً لنظامها الأساسي ولوائحها الداخلية وطبقاً للأنظمة النافذة في البلاد.